Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms