Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms