Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD11Q9BXL7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD11Q9BXL7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms