Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SHANK2-AS3Q9BTD1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SHANK2-AS3Q9BTD1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SHANK2-AS3Q9BTD1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms