Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPIFA3Q9BQP9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms