Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms