Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms