Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms