Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms