Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms