Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms