Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTF1AQ7RTS3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms