Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDZD4Q76G19 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms