Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms