Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms