Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms