Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms