Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms