Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD1Q5SYB0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms