Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms