Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms