Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms