Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms