Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4L6Q3SYB3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms