Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETM2Q2VYF4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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