Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms