Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GABRA6Q16445 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GABRA6Q16445 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GABRA6Q16445 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GABRA6Q16445 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GABRA6Q16445 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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