Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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