Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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ZNF56Q15929 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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ZNF56Q15929 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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ZNF56Q15929 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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ZNF56Q15929 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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ZNF56Q15929 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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ZNF56Q15929 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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ZNF56Q15929 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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ZNF56Q15929 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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ZNF56Q15929 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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