Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms