Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDH18Q13634 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH18Q13634 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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