Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2Q13563 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms