Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
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TCIRG1Q13488 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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TCIRG1Q13488 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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TCIRG1Q13488 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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TCIRG1Q13488 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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TCIRG1Q13488 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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