Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IKZF1Q13422 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IKZF1Q13422 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms