Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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