Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATMQ13315 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms