Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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