Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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