Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
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