Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SMARCB1Q12824 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SMARCB1Q12824 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SMARCB1Q12824 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SMARCB1Q12824 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SMARCB1Q12824 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SMARCB1Q12824 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SMARCB1Q12824 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SMARCB1Q12824 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SMARCB1Q12824 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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