Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms