Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms