Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX2Q04743 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms