Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms