Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms