Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms