Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms