Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms