Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms