Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms